Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Magister-/ Masterarbeiten

Richard Herrmann: Interpretable Rationale Extraction within Named Entity Recognition (Expose)

Masterarbeit Informatik
März 2022- November 2022
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik

Jessika Kranz: Performance optimization of an algorithm for DNA rewriting to achieve transgene packaging ability (Expose)

Masterarbeit Informatik
März 2022- September 2022
Betreuung: Ulf Leser, Knut Reinert (FUB)

Melanie Fattohi: Clinical classification of common cancers by means of deconvolution-based machine learning (Expose)

Masterrarbeit Bioinformatik FU Berlin
November 2021- Mai 2022
Betreuung: Tim Conrad (FUB), Ulf Leser

Leonard Clauss: Variable-Length Latent Motif Discovery (Expose)

Masterrarbeit Informatik
August 2021- Februar 2022
Betreuung: Patrick Schäfer, Ulf Leser, Henning Meyerhenke

Studienprojekte / Bachelorarbeiten

Fabio Barth: Evaluating Biomedical Event Extraction on a generative language model using TANL (Expose)

Studienprojekt Informatik
Juni 2022 - November 2022
Betreuung: Leon Weber, Ulf Leser

Michael Hirsch: Evaluating Dilation in Time Series Classification (Expose)

Studienprojekt Informatik
Juli 2022 - November 2022
Betreuung: Patrick Schäfer

Herny Beiker: Optimierung der Laufzeit von PREON (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
April 2022 - September 2022
Betreuung: Ulf Leser, Manuela Benary (Charite)

Alpay Yilmaz: Framework for Transfer Learning in Neuroimaging (Expose)

Studienprojekt Informatik
Januar 2022 - July 2022
Betreuung: Ulf Leser, Kerstin Ritter, Marc-Andre Schulz(Charite / BCCN) (Charite / BCCN)

Sunita Singh: Segmentierung von Aktivitätsdaten mit ClaSP (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
April 2022 - August 2022
Betreuung: Ulf Leser, Arik Ermshaus

Robin Knapp: FORCE on Argo Workflow (Expose)

Studienprojekt Informatik
März 2022 - July 2022
Betreuung: Ulf Leser, Fabian Lehmann, Vasilis Bountris

Adrian Dröse: Suchen und Ranken von klinischen Leitlinien (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
März 2022 - August 2022
Betreuung: Ulf Leser, Johannes Starlinger, Monika Nothacker (AWMF)

Tobias Riese: Early prediction of delirium on intraoperative EEG data using TEASER (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
December 2021 - Juni 2022
Betreuung: Ulf Leser, Susanne Koch (Charite)

Lennart Seiffer: How Workflow Management Systems address Kubernetes - A Taxonomy (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
December 2021- April 2022
Betreuung: Ulf Leser, Fabian Lehmann, Lauritz Thamsen

Alexander Salek: Lösen des NER-Problems auf dem deutschsprachigen Onkologie Korpus BRONCO mit Hilfe von Transformern (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
December 2021- April 2022
Betreuung: Ulf Leser, Alexander Löser (BHT Berlin)

Jakob Brand: Implementation of SFA in the MESSI framework (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Oktober 2021- April 2022
Betreuung: Patrick Schäfer, Ulf Leser, Henning Meyerhenke

Qiqi Chen: Softwarequalitätskontrolle – Risikoabschätzung von Softwareanforderungen (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Oktober 2021- Februar 2022
Betreuung: Ulf Leser, Lars Grunske