Treffen der AG-Textmining in Berlin
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AG-Textmining
Treffen am 12. Dezember 2005
Humboldt-Universität zu Berlin
[Programm] - [Teilnehmer] - [Veranstaltungsort] - [Anfahrt] - [Hotels]
Programm
| 10-13 Uhr | Berichte aus den Gruppen: Arbeitspakete zum Thema Annotationsrichtlinien, Analyse GENIA-Korpus |
| - Auswahl aus dem Genia-Korpus (JULIE, Joachim Wermter) | |
| - Annotation durch Studierende der Biologie (JULIE) | |
| - Inside-/Outside-Statistiken: Worte inner- und ausserhalb von Gennamen (EML, Jasmin Saric) | |
| - Machine Learning-Ansätze für Fehler (SCAI, Juliane Fluck) | |
| - wörterbuchbasierte Analyse/NER: Coverage von Proteinnamen (SCAI) | |
| - wörterbuchbasierte Analyse/NER: Gewebe (BRENDA, Jens Barthelmes) | |
| - wörterbuchbasierte Analyse/NER: Spezies (HUB, Jörg Hakenberg) | |
| - Kritik an der GENIA-Ontologie (UKLFR+JULIE, Stefan Schulz, Elena Beißwanger) | |
| 11.15 Uhr | Kaffeepause |
| 13-14 Uhr | Mittagspause |
| 14-17 Uhr | Diskussion und nächste Schritte |
| - Annotationsrichtlinien von UPenn, Georgetown, Tsujii-Lab (JULIE, Joachim Wermter) | |
| - Erweiterung der Richtlinien (genestete Entitäten etc.) | |
| - ggf. Verteilung weiterer Arbeitspakete: * Fertigstellung der formalen Definitionen für Konzepte der Genia-Ontologie * Analyse der Fehler im Geniakorpus * Re-Annotierung des Genia-Fragments durch mehrere Gruppen gleichzeitig * Abgleich der neuen Annotationen |
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| - erste Gedanken über gemeinsame Publikation/Vortrag (SMBM'06 ?) | |
| - Visualisierung von komplexen Netzwerken (BIOTEC, Loic Royer, Andreas Doms) | |
| - Termin für das nächste Treffen: Anfang März in Jena | |
| 15.15 Uhr | Kaffeepause |
| ab 17 Uhr | bei Bedarf: Besprechungen im kleineren Rahmen/Räumen |
Veranstaltungsort
Humboldt-Universität zu Berlin
Erwin-Schrödinger-Zentrum
Rudower Chaussee 26, Berlin-Adlershof
Vortragsraum 0'101, Erdgeschoss
Anfahrt
in Berlin:
- mit der S-Bahn S9 (z.B. vom Zoo, Ostbahnhof) in Richtung Flughafen Schönefeld oder der S8/42/85 (z.B. Ostkreuz) in Richtung Grünau/Spindlersfeld bis zum S-Bahnhof Adlershof;
- S9 vom Ostbahnhof: alle 20min, Dauer: 24min
S8 vom Ostkreuz: Dauer 15-19min, ggf. Umsteigen in die S9
für genaue Infos/Fahrpläne siehe BVG Routenplaner - weiter mit dem Bus 162, 163, oder 164 (1min Fußweg): zwei Stationen bis Magnusstraße
- zum Ibis-Hotel & Hotel am Campus: nur eine Station, bis Walther-Nernst-Straße
- siehe auch diese Skizze des Standorts Adlershof
- mir der DB zum Bahnhof Berlin Ostbahnhof, dann weiter wie oben
- am nächsten liegt der Flughafen Berlin-Schönefeld (SXF)
- ca. 10min Fußweg zum S-Bahnhof Flughafen Schönefeld, überdachter Säulengang und Tunnel
- von dort die S9/S45 in Richtung
Grunewald/Gesundbrunnen bis zur Haltestelle Adlershof
(drei Stationen)
- vom Flughafen Berlin Tegel (TXL)
- mit dem Bus X9 zum S+U-Bahnhof Jungfernheide (ca. 5min)
- von dort mit der S46 in Richtung Königs
Wusterhausen bis zur Haltestelle Adlershof (ca.
40min)
- vom Flughafen Berlin Tempelhof (THF)
- zu Fuß oder mit dem Bus 104 zum Platz der Luftbrücke (ca. 3 bzw. 1min).
- dort in die U6 in Richtung Alt-Mariendorf bis zum S+U-Bahnhof Tempelhof (ca. 3min)
- weiter mit der S45 in Richtung Schnönefeld,
bis zur Haltestelle Adlershof (ca. 15min)
- dann jeweils weiter wie oben
- zur B 96a: Adlergestell, Kreuzung Rudower Chaussee (S-Bahn-Unterführung)
- siehe Stadtplan
- Rudower Chaussee
Hotels
IBIS Hotel Adlershof
| Rudower Chaussee 15 12489 Berlin Tel: 030/67822-0 Fax: 030/67822-1000 |
Drahtlose Datenübermittlung Webseite/Online-Reservierung |
| Bei reservierten Zimmern: Anreise 15:00-19:00 Uhr, ansonsten bitte per Telefon Bescheid geben. | |
| Bushaltestelle: Walther-Nernst-Straße | |
IB-Hotel Am Campus
| Rudower Chaussee 14 12489 Berlin Tel: 030/75656-0 Fax: 030/75656-155 |
Webseite |
| Bei reservierten Zimmern: Anreise 15:00-20:00 Uhr, ansonsten bitte per Telefon Bescheid geben. | |
| Bushaltestelle: Walther-Nernst-Straße | |
This meeting is hosted by the Berlin Center for Genome Based Bioinformatics, BCB.