Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Übung zu Algorithmische Bioinformatik

Arik Ermshaus

Veranstaltung

Die Übung begleitet das Modul Algorithmische Bioinformatik. Ziel ist es, die Algorithmen der Vorlesung praktisch zu vertiefen. Dazu werden mehrere Programmieraufgaben in Python zu verschiedenen Themenkomplexen gestellt, die selbstständig in Arbeitsgruppen zu lösen sind. Der erste Termin findet am 28.10.2024 / 30.10.2024 statt und ist Pflicht für alle Teilnehmer.

Ablauf

An den Übungsterminen werden die Programmieraufgaben vorgestellt und Hilfestellungen gegeben. Die Bearbeitung erfolgt dann selbstständig in 3er-Arbeitsgruppen und die Abgabe erfolgt über Moodle. Jede Übungsgruppe muss ihre Ergebnisse von min. einer Übungsaufgabe im Semester vorstellen. Die erfolgreiche Bearbeitung aller Programmieraufgaben sowie die Vorstellung der Ergebnisse einer Programmieraufgabe ist dir Voraussetzung für die Zulassung zur Prüfung.

Termine (in Präsenz)

Der erste Termin ist Pflicht für alle Teilnehmer. Im Semester werden an den Terminen neue Programmieraufgaben vorgestellt, Fragestunden abgehalten und Ergebnisse präsentiert.

Gruppe 1 Montag 13 - 15 Uhr RUD26, 0'307
Gruppe 2 Mittwoch 13 - 15 Uhr

RUD26, 0'307

Organisatorisches

  • Voraussetzungen: gute Kenntnisse in Python sowie Algorithmen (bspw. Modul Algorithmen und Datenstrukturen)
  • Die Einschreibung zur Übung hat in Agnes und Moodle zu erfolgen. Das Moodle-Passwort wird in der ersten Übungsveranstaltung bekannt gegeben.
  • Die Gruppenbildung wird ausschließlich über Moodle abgewickelt.
  • Insgesamt sind mehrere Programmieraufgaben in Python zu bearbeiten, die jeweils Verständnis, Design, Implementierung und Test von komplexen Algorithmen umfassen.
  • Die Bearbeitung der Programmieraufgaben erfolgt in Dreiergruppen, d. h., es werden nur Lösungen solcher Gruppen in die Wertung aufgenommen. Für die Gruppenbildung sind die Teilnehmer eigenverantwortlich.
  • Voraussetzungen für das Bestehen dieser Übung ist das das erfolgreiche Bearbeiten aller Programmieraufgaben sowie die Vorstellung der Ergebnisse einer Programmieraufgabe.
  • Nach bestandener Übung wird ein Schein ausgestellt. Der Übungsschein berechtigt zur Teilnahme an der Prüfung zur Vorlesung "Algorithmische Bioinformatik".