Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Diplomarbeiten

Torsten Schiemann: Disambiguierung von biomedizinischen Termen mit Unterstützung maschineller Lernverfahren (Expose)

Diplomarbeit Informatik
Mai - November 2006
Betreuung: Jörg Hakenberg (TU Dresden), Prof. Leser

Christoph Wagner: Indizierung von Graphen zur Beantwortung von Erreichbarkeits- und Distanzanfragen (Expose)

Diplomarbeit Informatik
Mai 2006 - November 2006
Betreuung: Silke Trißl, Prof. Leser

Samira Jaeger: Konservierte Cluster in Protein-Interaktionsnetzwerken (Expose)

Masterarbeit Bioinformatik
April 2006 - September 2006
Betreuung: Prof. Leser, Prof. Reinert, Freie Universität Berlin

Stephan Ahl: Visuelle Graphanfragen für biologische Netzwerke (Expose)

Diplomarbeit Informatik (Freie Universität Berlin)
Januar 2006 - Oktober 2006
Betreuung: Prof. Leser, Prof. Voisard, FU Berlin

Raphael Bauer: Validierung von Genomannotationen (Expose)

Diplomarbeit Informatik
Januar 2006 - August 2006
Betreuung: Prof. Leser, Dr. Felix Bübl, Epigenomics AG

Nicky Hochmuth: Präfix-Bäume als Indexstruktur für String-Attribute in relationalen Datenbanken (Expose)

Diplomarbeit Informatik
Dezember 2005 - Juni 2006
Betreuung: Prof. Leser

Martin Schmidt: Semi-supervised machine learning: Can text mining help identify genes associated with obesity? (Exposé)

Diplomarbeit Informatik
Dezember 2005 - Juni 2006
Betreuung: Jörg Hakenberg, Prof. Leser, in Kooperation mit Prof. Brockmann, Dr. Schmitt (Institut für Nutztierwissenschaften, Abteilung Züchtungsbiologie)

Mirko Hochmuth: Auswirkungen von Sprachkontaktphänomenen auf phylogenetische Algorithmen (Exposé)

Diplomarbeit Informatik
August 2005 - März 2006
Betreuung: Prof. Leser, Prof. Lüdeling, Lukas Faulstich

David Weese: Entwurf und Implementierung eines generischen Substring-Index (Expose)

Diplomarbeit Informatik
November 2005 - Mai 2006
Betreuung: Prof. Reinert, Freie Universität Berlin, Prof. Leser

Studienarbeiten

Christian Brandt: Phylogenie von Graphen - Ahnlichkeit metabolischer Netzwerke (Expose)

Studienarbeit Informatik
Juni 2006 - November 2006
Betreuung: Prof. Leser

Marcus Pankalla: Suche und Clustering mit Textreferenzen zu PDB-Strukturen (Expose)

Bachelorarbeit Bioinformatik (Freie Universität Berlin)
Juli 2006 - September 2006
Betreuung: Jörg Hakenberg

Johannes Vogt: Visualisierung GRIPP-indexierter Graphen (Expose)

Studienarbeit Informatik
April 2006 - August 2006
Betreuung: Silke Trißl, Prof. Leser

Christian Rothe: Ausnutzung von Graphindexen zur Optimierung von SparQL-Anfragen, (Expose)

Studienarbeit Informatik
April 2006 - August 2006
Betreuung: Ralf Heese (DBIS), Prof. Leser

Alexander Haupt: Identifikation von Proteinen anhand von MS/MS-Fragmentspektren

Studienarbeit Informatik
Januar 2006 - August 2006
Betreuung: Dr. Scheler, ProteomeFactory AG; Prof. Leser

Thomas Trost: Ein Compiler für PQL mit zwei Backends, (Expose)

Studienarbeit Informatik
November 2005 - August 2006
Betreuung: Prof. Leser

Marcus Ertelt: Auswertung eines Microarray Experiments zum Gen ST6Gal-1 in Brustkrebszellen

Studienarbeit Informatik
Januar 2006 - Juli 2006
Betreuung: Prof. Leser, Dr. Kemmner, MDC