Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Magister-/ Masterarbeiten

Valentin Noske: NGS-based phenotype determination in sepsis patients with machine learning methods (Expose)

Masterarbeit Wirtschaftsinformatik
May 2024
Betreuung: Ulf Leser, Knut Reinert

Dan Plischke: Leveraging Active Learning for Few-Shot Relation Extraction using Large Language Models in the Biomedical Domain (Expose)

masterarbeit Wirtschaftsinformatik
01/2024
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik

Studienprojekte / Bachelorarbeiten

Luis Neuhaus: FORCE auf Snakemake (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
09/2024
Betreuung: Ulf Leser, Matthias Weidlich

Tobias Arndt: Ensembling in Time Series Segmentation (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
09/2024
Betreuung: Arik Ermshaus, Ulf Leser

Alexandria Arnold: LLMs für Workflow Testing and Debugging (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
08/2024
Betreuung: Ulf Leser, Thomas Kosch

Friedrich Tschirpke: Online Tarema: Learning Task and Infrastructure Characteristics at Workflow Runtime (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
May 2024
Betreuung: Ulf Leser, Odej Kao

Marc Spitzner: Denoising Diffusion Probabilistic Models as image encoders for vision-language tasks in remote sensing (Expose)

Studienproject Informatik
March 2024
Betreuung: Ulf Leser, Pedram Ghamisi

Elke Kohlmann: Vulnerability Detection with Finetuned Large Language Models

Bachelorarbeit Informatik
11/2024
Betreuung: Lars Grunske, Patrick Schäfer

Anika Ilieva: Evaluating Dilated Time Series Segmentation in ClaSP (Expose)

Studienprojekt Informatik
11/2024
Betreuung: Patrick Schäfer

Felix Kummer: Scientific Workflow Partitioning for Federated Execution (Expose)

Studienproject Informatik
04/2024
Betreuung: Ulf Leser, Xing Wang

Elias Gürlich: Extraktion dogmatischen Wissens aus Gesetzeskommentaren mit der Hilfe von Large Language Models (LLMs) (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
03/2024
Betreuung: Ulf Leser, Axel Metzger

Marc Schatz: Recurrent Neural Networks: a promising approach to predict spike times of a single neuron in comparison to biophysical models (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
3/2024
Betreuung: Ulf Leser, Susanne Schreiber

Duy Le Thanh: Biomedical Information Retrieval using large scale PubMed References (Expose)

Studienproject Informatik
02/2024
Betreuung: Ulf Leser, Xing Wang

Kay Steinbauer: Erweiterung des HunFlair-Frameworks zur Erkennung genetischer Varianten in biomedizinischen Texten (Expose)

Studienprojekt Informatik
02/24
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik

Mario Jäckle: LLM based translations of nf*core workflows to snakemake (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
01/2024
Betreuung: Ulf Leser, Thomas Kosch

Ronja Spiegelberg: Wörterbuch-basierte Normalisierung biologischer Entitäten (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
01/2024
Betreuung: Ulf Leser, Henning Meyerhenke

Florian Friederici: Memory thrifty workflow resource assignment (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
01/24
Betreuung: Ulf Leser, Henning Meyerhenke

Asmaa Hamami: Untersuchung von subjektiven visuellen Merkmalen zur Wahrnehmung von Deepfakes.

Bachelorarbeit Informatik
Betreuung: Thomas Kosch, Patrick Schäfer

Niyaz Huseyn-zada: Multivariate Motif Discovery with Motiflets (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Betreuung: Patrick Schäfer, Matthias Weidlich

Melanie Wüstner: Methods on Open Set Recognition for time series data (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Patrick Schäfer