Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Masterarbeiten

Duy Le Thanh: Training Dense Retrieval Models for Document Recommendation using PubMed Central Full-Text References (Expose)

Masterarbeit Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Xing Wang, Alan Akbik

Yuduo Wang: Utilizing Text Modality to Uncover Insights from Remote Sensing Images (Expose)

Masterarbeit
12/2024
Betreuung: Ulf Leser, Pedram Ghamisi

Felix Kummer: Scientific Workflow Partitioning for Federated Execution (Expose)

Masterarbeit
12/2024
Betreuung: Ulf Leser, Odej Kao

Robert Martin: Synthetic Queries vs Data Aggregation: How to improve Neural Document Retrieval for the Biomedical Domain (Expose)

Masterarbeit
12/2024
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik

Melanie Wüstner: Evaluating Downsampling algorithms for visualization as a preprocessing step for Time Series Segmentation with ClaSP (Expose)

Masterarbeit
July 2024
Betreuung: Patrick Schäfer, Matthias Weidlich

Studienprojekte / Bachelorarbeiten

Simon Bosse: Creating a question answering dataset for scientific workflow code (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Ulf Leser

Kevin Trogant: Estimating the Potential for Reduced Energy Consumption for Scientific Workflows by using DVFS in Nextflow (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Philipp Thamm

Julian Kremer: Applying the Large Language Model "LLaMA" to Analyze Dynamics on the Social Network "Truth Social"

Bachelor Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik

Alexander Reinecke: Impact of multimodal pretraining on patient similarity drivers (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Oguz Serbetci

Paul Permantier: Optimierung der Datenanalyse von deutschen Gerichtsurteilen durch RAG mit LLMs (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Herbert Zech

Sunita Singh: Comprehensive Annotation of Temporal Patterns in the Time Series Segmentation Benchmark (TSSB) (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Arik Ermshaus

Angelina Jellinek: Modularisierung der Implementation des Klassifizierungsmodells SynCoTrain (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Philipp Brenner (BAM)

Fabian Hohenstein: Kontextgebundene Optimierung von Edit-Distanzmaßen zwecks Entity Linking (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Henning Meyerhenke

Sedra Abou Ghaloun: Cross-Cohort Integration of Genetic Data for Disease Risk Analysis (Expose)

Studienprojekt Informatik
Betreuung: Ulf LEser, Julius Upmeier (BIH)

Paul Kalz: Realtime Early Time Series Classification with TEASER (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Betreuung: Ulf Leser, Matthias Weidlich

Victor Munacoha: Implementing the Spikelet Algorithm into ClaSP: An Analysis of Performance Improvement (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
Dezember/2024
Betreuung: Patrick Schäfer, Matthias Weidlich

Ayda Yilmazer: Evaluating Large Language Models based on Clinical Practice Guidelines for Precision Oncology (Expose)

Studienprojekt Informatik
11/2024
Betreuung: Ulf Leser

Bela Paulus: Adapting the Common Workflow Scheduler to Argo’s Workflow Model (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
11/2024
Betreuung: Ulf Leser, Matthias Weidlich

Sebastian Kühnen: Automatic Identification and Classification of Tennis Strokes During Professional Tennis Matches using an Ensemble of TSC techniques (Expose)

Bachelorarbeit Informatik
November 2024
Betreuung: Patrick Schäfer, Tony Bagnall

Simon Maximilian Friedo: A reproducibility study of state-of-the-art classifiers for deep learning on time series (Expose)

Studienprojekt Informatik
April 2024
Betreuung: Patrick Schäfer